离职证明，求助

本人03年毕业某重点大学，同年进入一国有企业，合同为03年-08年，由于档案我放在人才市场，所有档案没有转。

06年该企业进行分离破产。06年8月重新签订合同，时间为06年8-11年8月，该合同有个个人离职赔偿说明，指明为一个《××试行文件》，但是该文件在签订合同时并未出台，由于当时本人那没有打算离职，所以也没有询问此事。

11月份公司出台一个试行文件，称离职人员按照(签订时间-工作时间)*5000计算赔偿。

现在本人由于家庭原因需要辞职。请问各位专家。公司出台该文件是否合法?如果我辞职是否要交2万多元违约金呢??